A nagy tudományos és történeti értékkel bíró kiállítási tárgyak közül kiemelendő a több, mint 500 korabeli fényképet tartalmazó gyűjtemény. A fényképek főként a két világháború közötti időszakban készültek, és olyan, az egyetemi élet szempontjából meghatározó pillanatokat örökítenek meg, mint a királyi család egyetemlátogatása vagy az első díszdoktori diplomák átadása. A kiállítás további részei: az egyetem tanárairól készült fényképek gyűjteménye a két világháború közötti időszakból, a második világháború idejéből származó fényképgyűjtemény (Emil Fischer hagyatéka), az egyetem szebeni működésének időszakából való képek stb.
- Egyetemtörténeti Múzeum
- Ásványtani Múzeum
- Ásványtani Múzeum / Drágakőgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Elsőként Romániában felfedezett ásványok gyűjteménye
- Ásványtani Múzeum / Erdélyi-középhegységből származó zeolitok
- Ásványtani Múzeum / Ikerkristály-gyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Kristálytani kiállítás
- Ásványtani Múzeum / Meteoritgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Regionális ásványgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Rendszertani gyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Romániai barlangokból származó ásványok gyűjteménye
- Ásványtani Múzeum / Romániai drágakőgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Termésarany gyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Tudományos vizsgálati eszközök
- Növénytani Múzeum
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Erdélyi-medencére vonatkozó rétegtani gyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Nyílt-színi gyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Típusgyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Általános rétegtani gyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Őslénytani taxonómiai gyűjtemény
- Állattani Múzeum
- Vivárium
- David Prodan Emlékmúzeum
- Észak-erdélyi Holokauszt Dokumentációs Múzeuma