Ez a gyűjtemény diákigazolványokat, egyetemi vagy doktori okleveleket, szabályzatokat, évkönyveket foglal magába, és sokatmondó vallomások, tanúbizonyságok sorozatát vonultatja fel a kolozsvári egyetem különféle didaktikai, tudományos vagy kutatási szakjainak történelmi változásáról és fejlődéséről. Ezek az egyetemi dokumentumok ugyanakkor képet nyújtanak a látogatók számára az elmúlt két évszázad társadalmi és politikai rendszereinek jellemvonásairól.
- Egyetemtörténeti Múzeum
- Ásványtani Múzeum
- Ásványtani Múzeum / Drágakőgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Elsőként Romániában felfedezett ásványok gyűjteménye
- Ásványtani Múzeum / Erdélyi-középhegységből származó zeolitok
- Ásványtani Múzeum / Ikerkristály-gyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Kristálytani kiállítás
- Ásványtani Múzeum / Meteoritgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Regionális ásványgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Rendszertani gyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Romániai barlangokból származó ásványok gyűjteménye
- Ásványtani Múzeum / Romániai drágakőgyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Termésarany gyűjtemény
- Ásványtani Múzeum / Tudományos vizsgálati eszközök
- Növénytani Múzeum
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Erdélyi-medencére vonatkozó rétegtani gyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Nyílt-színi gyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Típusgyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Általános rétegtani gyűjtemény
- Őslénytani és Rétegtani Múzeum / Őslénytani taxonómiai gyűjtemény
- Állattani Múzeum
- Vivárium
- David Prodan Emlékmúzeum
- Észak-erdélyi Holokauszt Dokumentációs Múzeuma