Peste 500 de clişee pe hârtie, dar şi pe sticlă ori celuloid, prezintă în imagini elocvente momente marcante din viaţa universitară clujeană. Printre exponatele cu mare valoare ştiinţifică și istorică pot fi amintite: colecţia de fotografii care ilustrează vizitele familiei regale a României la Universitatea din Cluj, colecţia de fotografii cu profesori ai Universităţii din perioada interbelică, colecţia de fotografii din perioada celui de-al doilea război mondial (autor Emil Fischer), când Universitatea clujeană se afla în refugiu la Sibiu, etc.
- Muzeul de Istorie al Universității
- Muzeul de Istorie al Universității / Colecţia de documente academice
- Muzeul de Istorie al Universității / Colecția de cărţi poştale
- Muzeul de Istorie al Universității / Colecția de instrumente științifice
- Muzeul de Istorie al Universității / Colecția de medalii, sigilii și insigne
- Muzeul de Istorie al Universității / Colecții
- Muzeul de Mineralogie
- Muzeu de Mineralogie / Colecții
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia de aur nativ
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia de geme
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia de geme din România
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia de macle
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia de meteoriţi
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia de minerale descoperite pentru prima dată din ocurenţe din România
- Muzeul de Mineralogie / Colecţia regională de minerale din România
- Muzeul de Mineralogie / Expoziţia cristalografică
- Muzeul de Mineralogie / Instrumente ştiinţifice istorice
- Muzeul de Mineralogie / Minerale din peşteri din România
- Muzeul de Mineralogie / Zeoliţi din Munţii Apuseni
- Muzeul Botanic
- Muzeul de Paleontologie și Stratigrafie
- Muzeul Zoologic
- Vivariul
- Muzeul Memorial David Prodan
- Muzeul Holocaustului